Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT2

TDRD5, Tudor domain-containing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD5Q8NAT2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD5Q8NAT2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms