Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATG16L2Q8NAA4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms