Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms