Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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