Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms