Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms