Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms