Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTN1Q16799 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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