Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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