Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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