Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLD3Q15054 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLD3Q15054 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms