Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NWD1Q149M9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NWD1Q149M9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms