Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE3AQ14432 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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