Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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