Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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