Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms