Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHAF1AQ13111 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CHAF1AQ13111 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CHAF1AQ13111 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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