Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms