Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPP3CAQ08209 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms