Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms