Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HBBP68871 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HBBP68871 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms