Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AIF1P55008 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AIF1P55008 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AIF1P55008 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AIF1P55008 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms