Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms