Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF6P49848 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms