Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCLMP48507 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms