Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms