Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRAFP15056 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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