Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GP1BBP13224 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms