Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RLBP1P12271 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RLBP1P12271 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms