Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBP07199 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPBP07199 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBP07199 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBP07199 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBP07199 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBP07199 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBP07199 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBP07199 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms