Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1P04632 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms