Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG7O95352 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG7O95352 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms