Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIF1CO43896 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIF1CO43896 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIF1CO43896 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KIF1CO43896 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KIF1CO43896 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms