Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA8JA6NMD2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms