Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms