Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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