Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms