Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms