Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS6Q96GS4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms