Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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