Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINGO1Q96FE5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms