Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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