Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms