Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms