Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SUMO4Q6EEV6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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