Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL3Q6DD88 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms