Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms