Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms