Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms