Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms